脑干堵塞有一部分患者通过治疗可以完全改善症状，达到临床上的治愈，但大部分患者可能会留下后遗症，主要与治疗的时间窗以及后续的康复锻炼相关。一般情况下，如果在6小时内进行溶栓取栓的治疗，这种情况下80%的患者可以治愈，不留后遗症，症状能完全改善，但是对于大脑来说，病灶可能会一直存在。
所以对于脑干梗塞的患者，大概有一半通过溶栓取栓以及后续积极地康复锻炼可以治愈，还有一部分患者可能会留下严重的后遗症，通过积极地治疗，到半年左右还会留下一些肢体瘫痪，或者出现吞咽困难，饮水呛咳等症状。所以对于脑干梗塞患者，早期的积极治疗尤为重要，要尽快给予溶栓取栓，为后续的完全治愈打下基础。
