巧克力囊肿也叫子宫内膜异位囊肿，是长在卵巢上的子宫内膜异位症所形成的囊肿。子宫内膜异位症在女性中是比较常见的妇科疾病，发生在腹膜上就形成腹膜型内膜异位症，长在卵巢上就形成卵巢囊肿，叫卵巢型子宫内膜异位症，由于它囊内会有反复的出血，所以囊液看起来是褐色的，比较黏稠，像巧克力液，所以叫巧克力囊肿，这一类型是最常见的。
另外，还有一种类型是深部浸润型的子宫内膜异位症，如果检查出现巧囊，还会有一些症状，比如痛经、出现继发不孕，这些情况需要手术治疗。
卵巢子宫内膜异位囊肿，目前现在最佳的治疗方法是采用腹腔镜手术，是一个微创手术方式，腹腔镜检查、手术，术后辅助药物治疗，然后进行生育管理，这是比较好的治疗方法。
子宫内膜异位症患者，不仅要把病灶消除，还要保护其卵巢功能，恢复其盆腔解剖结构，有较多患者是内膜异位症患者，有比较严重的盆腔粘连，恢复其正常的解剖结构，能够保护她的生育能力，这是临床治疗很重要的目标。
