导致患者脚里面骨头疼痛的原因很多，主要见于扁平足、畸形、骨性关节炎、痛风、类风湿关节炎、外伤以及肿瘤这些因素。
1、扁平足：患者如果存在扁平足，导致张力不足，就容易导致患者脚里面的骨头存在疼痛症状。
2、畸形：患者如果存在马蹄内翻、拇外翻畸形，会使得足部的着力点发生变化矫治，就会引起脚里面的骨头出现明显的疼痛。
3、骨性关节炎：退变会引起软骨损害，从而导致患者出现脚邻面的骨头存在疼痛。
4、痛风：食用过多含有嘌呤的食物，尿酸排泄障碍，尿酸升高，尿酸结晶盐沉积于关节周围，会对局部的关节软骨造成损害，也会引起患者邻面的骨头存在疼痛。
5、类风湿关节炎：会引起关节囊、韧带、肌腱、软骨和骨发生炎性反应，从而导致脚里面的骨头存在疼痛症状。
6、外伤：足部受到外力作用，会引起骨的连续性或者完整性发生中断，或者导致关节存在脱位，也会导致脚骨头疼痛，往往会伴随有皮下淤斑、肿胀、畸形、活动障碍。
7、肿瘤：原发性或是转移性的骨肿瘤也会造成骨的损害，从而引起脚里面的骨头疼痛。
