法布里综合征是一种多器官、多系统疾病，主要累及肾脏系统、神经系统、皮肤系统等，也可能会累及心脏、眼部等部位，出现肾脏症状、神经症状、皮肤症状、心脏症状、眼部症状。
1、肾脏症状：法布里综合征可导致肾小管功能不全、肾脏功能异常，包括浓缩、稀释、酸化功能等障碍，主要表现为高血压、血尿、蛋白尿、脂肪尿等，部分患者可以出现水肿，甚至部分患者在20-40岁起就可以出现蛋白尿、渗尿、肾功能衰竭等症状；
2、神经症状：典型表现是肢端感觉异常、疼痛，也是儿童和青春期患者比较突出的症状，一般在30-40岁时发作会减少；
3、皮肤症状：表现为血管胶质瘤，出现于儿童时期，随着年龄增长而增大，多呈扁平状或轻度隆起，为暗红色或黑色，压之不褪色。比较大的血管胶质瘤可以呈现轻度角化，皮肤损害可以发生在任何部位，以腰至膝间最为密集，常伴有少汗、无汗等症状；
4、心脏症状：心脏受到伤害是患者死亡的原因之一，主要表现为传导功能障碍，随着年龄的增大，心肌病的发病率也逐渐增加，患者可以出现乏力、呼吸困难等症状，甚至伴有颈静脉怒张、肝肿大、腹水、水肿等症状，部分患者可以合并心绞痛、心律失常等；
5、眼部症状：眼部症状是本病的特征性变化之一，可以见到角膜混浊现象，如白内障、视网膜血管迂曲、扩张等，且角膜可能会有旋涡状沉积物，导致轻度视力减退。