B超检查是产前检查的重要内容，是了解胎儿生长发育和判断胎儿宫内安危的重要辅助检查，也是胎儿外表畸形的主要筛查方法。如果进行了试管移植，再移植后28天左右进行B超检查可以帮助判断孕囊发育情况，看孕囊是否在宫内，是否有卵黄囊、胎芽、胎心等的发育，排除异位妊娠、胚胎停育等可能。
胚胎移植入母体后，如果子宫内膜不适宜着床，可能会游离到输卵管，在输卵管着床妊娠，出现宫外孕的情况，通过B超可以初步判断有无宫外孕可能，另外可以通过B超对胚胎停育做出诊断，诊断标准为胎芽≥7mm而无心脏搏动；孕囊平均直径≥25mm但无胎芽胎心；检查出无卵黄囊的孕囊2周后不见有不见有心跳的胚胎；检查出有卵黄囊的孕囊11天后任不见有心跳的胚胎。如果确诊有宫外孕或者是胚胎停育，要及时住院治疗。
