咽后脓肿的治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。
一、药物治疗
抗生素的应用：咽后脓肿蜂窝织炎阶段或者早期小的脓肿，足量有效的抗生素可以治愈大部分患者。可以根据脓液细菌培养并药敏试验的结果选择合适的抗生素，试验结果出来前可经验性的使用广谱抗生素，如青霉素、阿莫西林、头孢菌素类。如患者有抗生素过敏史，应注意及时告知医生更换其它药物治疗。
二、手术治疗
外科引流分为口内入路和颈部入路两种途径：
1、经口途径：单纯咽后脓肿首选经口途径切开引流。随着医疗的进步，现代医学多采用全麻手术，以避免患者不配合挣扎导致脓肿破裂流入下呼吸道引起窒息和引流不彻底。
2、经颈部途径：经口引流失败，或者咽后脓肿播散到咽旁间隙、颈血管间隙、内脏前间隙，或者形成下行性纵隔及胸膜感染、颈椎结核引起者，需要经颈部途径切开引流。
经过呼吸道管理、CT等检查早期发现咽后脓肿，抗生素有效使用和外科及时干预。咽后脓肿预后通常良好，引起死亡者少见。
