中枢神经系统感染是指各种病原微生物进入脑、脊髓引起的急性或慢性炎症感染。常见的会导致中枢神经系统感染的病原微生物有病毒、细菌、真菌、螺旋体、寄生虫等，这些病原微生物通常会在人体抵抗力下降的情况下进入人体，有三种途径。
1、血行感染：病原体通过一些昆虫或者动物咬伤人体的皮肤黏膜后进入血液，或者由输血、静脉注射，将病原微生物带入血流。
2、病原微生物直接感染：比如发生颅外伤，或者颅脑的邻近组织感染之后，病原体蔓延进入颅内。
3、沿着神经逆行性的感染：比如一些嗜神经的病毒，首先会感染皮肤或者呼吸道、胃肠道，之后经神经末梢逆行进入的神经干，顺着神经干进入颅内发生感染。
