大多数经期头痛是偏头痛，患者可以选择治疗偏头痛的药物治疗。药物有好几种，大多有一定副作用，还是需要医生帮助选择。另外女性经期激素水平会出现波动，跟头痛的诱发有较大关系。有些患者是月经后期疼，有些患者是月经初期疼，所以患者在选择止痛药物时要选择治疗时间，并不是吃得越早越好或越多越好，而应该选择正常时间，要预测头痛的发作时间，提前1天寻求治疗方法，如针刺、放松疗法、按摩或者适当体育锻炼，对有些轻度头疼可以起到预防的作用。
治疗偏头痛的药物有预防复发和疼痛发作后缓解疼痛两类，预防疼痛的药物有降压药、β受体阻滞剂，既有降压的作用，同时也有预防偏头痛发作的作用。如果经期头痛每次都是在月经初期或月经后期，很容易预测发作时间，提前服用上述药物，就可以起到预防的作用。如果没有预防好，疼痛比较厉害，可以选择非甾体抗炎药，就是常见的退热镇痛药；如果比较严重的、顽固的头痛就要选择曲普坦类的特殊的偏头痛缓解药物。
