口腔癌主要跟口腔溃疡，以及其他口腔黏膜病、口腔良性肿瘤进行鉴别。口腔溃疡是一种常见的黏膜病，表现是口腔内反复发生的小溃烂，有红、黄、凹、痛的症状。一般即使不治疗，7-10天也能自愈。
但是癌性溃疡不但不会自愈，而且会不断发展加深，变成凹坑状、周围浸润且有菜花样肿物的口腔癌。口腔癌还要跟许多口腔黏膜病来鉴别，如口腔白斑、口腔红斑和黏膜下纤维化等，上述黏膜病都有一定的几率变成口腔癌。
当口腔黏膜病出现溃烂和肿物增生以后，要警惕可能已经转变成口腔癌，是很重要的鉴别诊断。此外口腔癌因为有很多位置比较靠后，比较难以诊断。很多患者是因为明显疼痛来就诊，常被误诊为神经痛。
