系统性红斑狼疮目前不能治愈，但经过科学治疗患者症状可缓解。红斑狼疮性肾炎Ⅳ型较难治疗，通常采用激素加环磷酰胺及硫唑嘌呤治疗，其它治疗方案包括血浆置换、静滴丙种免疫球蛋白、环孢素、霉酚酸酯等，但治疗各有缺陷并且远期疗效不同，采用时需根据实际情况慎重考虑。

患者可选择中草药加激素治疗，中药可减少激素使用量、减轻副作用、改善自觉症状、调节机体免疫功能，同时可减轻患者长期应用激素造成的惧怕心理，可作为长期维持治疗方法。

系统性红斑狼疮患者经过积极治疗后，可达到长期生存，如10年生存率可达90%以上、15年生存率可达60%。狼疮肾炎诊断和治疗进步，其预后逐渐可观。局灶增生性肾损害者，5年存活率达75%-80%；膜性肾病患者5年存活率可达85%；弥漫性增生性狼疮性肾炎患者预后较差。尤其伴高血压和氮质血症患者，20世纪70年代5年生存率仅25%，近年来由于激素和细胞毒药物的应用及良好监测，患者5年存活率可超过80%，10年存活率可超过60%。