乙肝小三阳的治疗要根据乙肝病毒复制情况、肝功能、肝脏的形态、是否出现并发症，来采取定期检查、饮食控制、对症药物和抗病毒治疗等。乙肝小三阳属于乙肝病毒感染的一种状态，大多数的乙肝感染者是乙肝病毒低复制状态，就可以表现为乙肝小三阳，抽血检测乙肝病毒测不出，或者是处于相对较低的水平，肝功能完全正常，称为乙肝病毒携带者。
上述情况不需要药物治疗，平时饮食要保证营养均衡，严格的戒烟、戒酒，避免劳累熬夜，避免伤肝的药物以及不良的生活方式、定期检查，乙肝小三阳可以长期的保持稳定的状态。如果乙肝病毒活跃复制，同时合并有肝功能的异常，甚至是出现了慢性肝炎、肝纤维化以及肝硬化的表现，这种乙肝病毒则需要尽早的开始抗病毒药物治疗，抗病毒药物可以控制乙肝病毒的生长和活跃复制，延缓肝脏损伤的进展，在一定程度上降低肝硬化、肝癌的发生。
