早期甲状腺功能亢进一般不能自愈，甲状腺功能亢进属于自身免疫性疾病，一旦发生，都需要进一步治疗。部分患者发现自己甲状腺功能亢进，结果过段时间后恢复了正常，上述情况需要怀疑，是否为真的甲状腺功能亢进。有时T3(血清总三碘甲腺原氨酸)、T4(甲状腺素血清总甲状腺素)高，TSH(促甲状腺激素)低不一定只是甲状腺功能亢进，可能是对应的其他情况。如患者出现了甲状腺素毒症，甲状腺炎导致甲状腺素释放出来，也会出现甲状腺功能亢进的结果。若甲状腺功能得到了修复，甲状腺素没有被破坏释放，甲状腺功能可以恢复正常。

此外怀孕时，女性也常会碰到妊娠相关性甲亢，指由于怀孕时激素水平的变化，导致T3(血清总三碘甲腺原氨酸)、T4(甲状腺素血清总甲状腺素)水平增高，TSH(促甲状腺激素)降低。随着怀孕时间推进，一般3个月以后，β-HCG水平下降，患者的甲状腺功能可以自己恢复。由于自身免疫紊乱所导致的甲状腺功能亢进，一般不能自愈。