肚子疼即腹痛，肝内胆管结石可能出现腹痛。肝内胆管结石如果比较小，对于胆管不会造成梗阻，这时患者就不会有任何症状。只有做超声检查或者是其它影像检查时，可能发现结石的存在。
随着结石的增大，结石可能会造成肝内胆管的阻塞，这时如果胆管剧烈收缩，向下排送胆汁，就可能会诱发明显的胆绞痛。疼痛的位置主要体现为上腹或者是右上腹比较剧烈的疼痛，这种疼痛一般同时会伴有明显的发热、黄疸，化验会发现肝功能明显异常、血常规会升高。
在临床上出现腹痛，同时检查发现有肝内胆管结石，并不能完全确定就是结石导致的疼痛。需要结合疼痛的位置、伴随的症状，以及检查时肝内胆管、肝脏的情况，进行综合判断。
如果腹痛的同时并没有明确的肝内胆管扩张、肝功能损害，只是单纯发现肝内存在结石，通常疼痛与肝内胆管结石没有关系。需要结合疼痛部位以及性质、诱因等，检查、寻找其它导致疼痛的原因。
