甲状腺功能3项通常是指FT3、FT4和TSH，主要是游离的三碘甲状腺原氨酸、游离的甲状腺素以及促甲状腺激素，可能是在体内起作用的主要激素。除了甲状腺功能3项，还有甲状腺功能5项，5项还包括总T3和总T4，因为在体内起作用主要是游离的T3，游离T4要在外周组织中转化为T3以后再起作用。
所以对于甲减的患者，在调整药物的过程之中，查甲状腺功能3项，基本上可以解决问题。但是如果存在其它问题，包括妊娠期、存在其它甲状腺功能，或者肝脏功能和肾功能有问题，影响甲状腺结合球蛋白，或者影响血中的白蛋白，可能会影响总T3和总T4。此时可能需要查甲状腺功能5项。
对大多数患者，查甲状腺功能3项就可以反映甲状腺的功能状态，对于甲亢患者或者甲减患者，在治疗过程中调整药量，通常的甲状腺功能3项即可，参考游离T3、游离T4和TSH的水平，可以调整抗甲状腺素药物的量或者左旋甲状腺素的药量，随时根据功能进行药物的调整。
