跑步以后膝盖疼痛的原因众多，但是可以分成两大类原因，一个是跑步过程有些缺陷、问题，第二个就是膝关节本身有病变。
1、跑步过程有些缺陷、问题：平时跑步少、不怎么活动，突然开始运动，而且跑的量比较大，关节受到的刺激，活动度过度，韧带、肌腱、滑膜受到刺激，可以产生炎症引起疼痛。再一个就是道路选择不好，比如路面比较坚硬或者崎岖，或者鞋不合适，在跑的时候下肢受到的力量就不均衡，膝关节负重加大，也容易造成损伤性炎症；
2、膝关节本身有病变：原来膝关节本身就有病变，比如滑膜炎、骨关节退变、髌骨软化，韧带或者半月板损伤，在这种有基础病的情况下跑步过多，这个刺激把原发病诱发起来，出现症状，产生疼痛。
所以跑步以后膝关节疼大概分成这两类，一个就是跑步过程有问题需要调整，还有一类也就是原来有基础病，在活动时跑步以后，把基础病诱发，引起发作、发炎。
