萎缩性胆囊炎伴有胆囊结石，还是建议患者尽早通过外科手术将胆囊切除，如果长时间的推迟手术，则存在一定的风险。
这种风险既包括由于胆囊结石合并胆囊炎导致的疼痛等症状，或者出现细菌感染导致的感染性疾病，或者出现继发的胆管结石，或者胆源性胰腺炎。另外，长时间的胆囊萎缩也增加胆囊癌变的风险。所以对于已经确诊的胆囊结石合并胆囊萎缩，还是建议尽早通过外科手术治疗。
外科手术过程中可能会发现胆囊萎缩，或者胆囊局部解剖结构已经发生影响，如反复出现的炎症会增加手术难度，局部解剖结构不清楚，可能会增加手术当中出血、胆道损伤的风险。
因此对于萎缩性胆囊炎伴有胆囊结石患者尽早手术，一方面可以降低手术的难度，减少手术相关的并发症；另外一方面也可以显著降低胆囊癌变的风险，毕竟在我国大多数的胆囊癌，是在胆囊结石合并胆囊炎基础上而形成。
