烟酸缺乏症的病因包括摄入不足、不良生活习惯、药物、胃肠道疾患、先天性缺陷、类癌综合征等。
1、摄入不足：烟酸的主要食物来源是肝、肾、瘦肉、家禽、鱼、花生、豆类等。当这些食物摄入不足，缺乏维生素B1和维生素B2时均可引起烟酸缺乏症。见于以玉米为主食者，由于玉米所含的烟酸大部分为结合型，不经分解是不能为机体利用，加之玉米蛋白质中缺乏色氨酸，故容易发生烟酸缺乏症。
2、不良生活习惯：如酗酒时膳食摄入不足，进食不规律，当存在其他营养素摄入不足时易影响烟酸的吸收和代谢。
3、药物：一些药物可干扰烟酸代谢，其中了解最清楚的是异烟肼，有干扰吡哆醇的作用，而吡哆醇是色氨酸、烟酰胺代谢途径中的重要辅酶。某些抗癌药物，特别是巯嘌呤长期服用可导致烟酸缺乏。
4、胃肠道疾患：包括各种原因引起的长期腹泻、幽门梗阻、慢性肠梗阻、肠结核等可引起烟酸的吸收不良。
5、先天性缺陷：如Hartnup病，由于小肠和肾小管对色氨酸和其他几种氨基酸的转运缺陷引起。
6、类癌综合征：由于大量色氨酸转变为5-羟色胺而不转化为烟酸引起。
