骨髓炎分类较多，对于医源性、外伤引起的骨髓炎，如果确诊，毫无疑问进行手术治疗，需要通过手术清创，清除坏死的组织，清除感染的病灶，通过抗生素治疗达到感染的控制。如果患者是血源性骨髓炎，正好处在炎症发作期时，这时建议患者还是先应用一定的抗生素，等炎症病灶慢慢控制，局限变成慢性过程时，这时再进行病灶的清除。
如果患者是急性骨髓炎需要尽早手术，急性骨髓炎的患者越早手术对患者影响会越小，效果会越好。从医学上，急性骨髓炎手术是急诊手术，而且大多数见于儿童。大多数急性骨髓炎只要进行早期的治疗，患者预后基本上都不会转化为慢性的骨髓炎。但是如果急性骨髓炎治疗不及时，可能会转化为慢性的骨髓炎，只能控制慢性骨髓炎症状，让患者可能会带着窦道生存，甚至急性骨髓炎无法控制的状态。大多数患者通过手术治疗，可以控制骨髓炎的症状而不复发。
