肠镜分为大肠镜和小肠镜，平常所说的肠镜，通常是指大肠镜，即结肠镜，常见的观察部位如下：

1、大肠镜：通过肛门进入体内，可以观察到肛门、肛管、直肠、乙状结肠，通过乙状结肠到达降结肠，而后脾曲到达横结肠，通过肝曲、降结肠，到达回盲部，即大肠与小肠交界处，在此处可观察到回盲瓣以及盲肠内的阑尾开口，上述便是大肠镜，即结肠镜通常所看到的区域。结肠镜也可以看到小肠的最后一节，即回肠末端，通过大肠镜检查，可发现大多数肠道病变，上述区域的肠道病变，如肿瘤、息肉、血管畸形、憩室、溃疡、糜烂、肠结核或淋巴瘤等；

2、小肠镜：主要检查小肠，小肠的长度较长，可以达到4-5m，小肠盘曲于腹部中央，由于小肠的长度较长，小肠镜检查通常比较困难，通常需要在麻醉下进行，可以经口或经肛进行。如果需要完整检查整个小肠，可能需要经口和经肛结合检查才能够完善，此时有助于发现小肠的各种病变，如肿瘤、出血、憩室、小肠溃疡、糜烂等。