新生儿的室间隔膜周部缺损3mm，这种情况并不严重，随着时间的推移，大部分新生儿的膜部或膜周的室间隔缺损都可以自愈，不需要后期进一步的手术干预。同时新生儿3mm的室间隔缺损，对心室的结构和功能大部分不会产生严重影响，不会引起严重的血流动力学改变。建议新生儿定期追踪、复查心脏彩超，并在心血管内科的门诊进行随诊。
如果除室间隔膜周部3mm的缺损外，还合并其它较严重的心脏结构和功能异常，则整体预后便会决定于心脏畸形以及心脏功能的恢复情况。如果仅是单纯的3mm室间隔缺损，新生儿的生长发育及预后大部分比较良好，不会产生太大的不利影响。但是在随访过程中要注意合理喂养、合理护理，并定期进行相关的心电图、心脏彩超的检查，在医生指导下进行科学追踪。如果后期膜周的室间隔缺损已经自愈，则不需要再进行干预。
