病毒性脑炎治疗后可遗留不同后遗症，治疗方法不同，需要多学科共同治疗。病毒性脑炎常见后遗症包括癫痫、智力发育障碍、情绪障碍、运动功能异常、听力障碍等。治疗如下：

1、继发癫痫：需要接受抗癫痫药物治疗，大部分患儿可以控制癫痫发作，需要定期复查、遵从医嘱，避免自行停药或减药。部分患儿抗癫痫药物治疗疗效较差可以考虑生酮饮食、迷走神经刺激术、癫痫外科手术等治疗；

2、智力发育障碍：需要接受康复治疗或特殊教育；

3、情绪障碍：需要心理科或精神科医生协同参与诊治；

4、运动障碍：根据严重程度需要康复治疗，良好护理较为关键；

5、听力障碍：需要耳鼻喉科医生参与，部分甚至需要配戴助听器。

总之，病毒性脑炎可遗留不同程度后遗症，轻重程度不相同，重者可能需要鼻饲喂养、呼吸机辅助通气等治疗。轻者症状轻微，不影响正常学习和生活时，治疗不能一概而论。需要根据具体病情、相关科室共同讨论，多学科共同参与诊治，以最大可能提高患儿生活质量。