菊粉是除淀粉植物的另一种能量储存的形式，是生产低聚果糖、多聚果糖、高果糖浆、结晶果糖等产品的良好原料，具有控制血脂、降低血糖、促进矿物质的吸收、防止便秘、抑制腐生菌生长、减肥等功效。 1.控制血脂 适量摄入菊粉，可有效降低血清总胆固醇和低密度脂蛋白胆固醇，提高高密度脂蛋白与低密度脂蛋白比率，改善血脂状况。 2.降低血糖 菊粉是一种不会导致尿中葡萄糖升高的碳水化合物，它在肠道的上部不会被水解成单糖，因而不会升高血糖水平和胰岛素含量。 3.防止便秘 菊粉是一种天然的水溶性膳食纤维，几乎不被胃酸水解和消化，只有在结肠被有益微生物利用，从而改善肠道环境。 4.促进矿物质的吸收 菊粉能提高人体对于钙、镁、锌、铜、铁离子等矿物质的吸收。 5.抑制腐生菌生长 菊粉能够抑制腐生菌的生长，减少有毒产物的生成，减少其对肠壁的刺激。 6.减肥 菊粉可以提高内容物的粘度，降低食物从胃进入小肠的速度，从而降低饥饿感，能减少食物的摄入量，进而达到减肥的效果。

菊粉在肠道末端前，可以发酵成短链脂肪酸和乳酸盐，乳酸盐是肝脏代谢的调节剂。
菊粉中有少量的2-9低聚果糖，可使大脑神经细胞营养因子表达升高，具有良好的抗抑郁作用。
菊粉在结肠发酵生成的短链脂肪，使其黏膜上的隐窝变浅。菊粉发酵所产生的酸降低结肠pH，使得许多矿物质的溶解度、生物有效性得以提高，特别是短链脂肪酸可以刺激结肠黏膜细胞的生长，提高肠黏膜的吸收能力。