碘-131在临床治疗时副作用并不大，临床工作实践已经证实。碘-131治疗主要用于甲状腺功能亢进，对于甲状腺肿大伴有甲亢患者的治疗，效果非常好，即Graves病。碘-131治疗以后，可以使甲状腺组织萎缩、缩小，由肿大状态变成正常大小，从而使得甲状腺功能由亢进变得正常，甚至低下，甲状腺功能亢进恢复正常。
此外，其还可治疗甲状腺癌转移灶。对于甲状腺癌转移灶，必须是甲状腺癌转移灶能够摄取碘-131才可以，如果不能够摄取，碘-131治疗无效。所以在临床当中，一定要对碘-131治疗适应症进行明确的判断。临床常常发现，部分甲状腺功能亢进患者不能够做碘-131，因为甲状腺摄碘能力很低，同理，甲状腺癌转移灶也一样，如果甲状腺癌转移灶不摄取碘-131，也不能够用这种方式治疗。
