很多的糖尿病患者，在治疗过程中，会用到胰岛素治疗，但是现在在测血中胰岛素水平的时候，很难断开到底胰岛素是注射的还是自己分泌的。所以如果已经使用胰岛素的患者，评估一下胰岛功能，可能血中的胰岛素水平不能更好地反映胰岛的功能，就需要用到C肽。
因为C肽和胰岛素是等分子从β细胞分泌出来，胰岛素经过肝脏，血中的C肽水平相对来说比较恒定。所以测定血中的C肽的水平，可以初步地判定现在患者的胰岛功能的状态。
做的时候也可以做空腹C肽，或者是给予吃馒头以后，刺激以后看看C肽水平的反应的曲线。主要是用来评估基础状态下，或者是刺激以后，胰岛功能的储备还有多少。
C肽另外的临床意义，可能就是它有一部分，可能对糖尿病的血管病变有保护的意义，但是这个仅限在临床研究中。实验研究中临床中，确实还没有看到C肽对糖尿病的周围血管、神经、视网膜的保护，但是如果确实有这方面数据支持，C肽还有这个临床的作用。
