不孕不育分为女性和男性不孕不育，不能成功怀孕的称不孕症，种种原因流产、死胎的称不育症。女性甲亢常出现月经减少甚至闭经，男性甲亢会出现阳痿、性功能减退的状况。甲亢还可以影响男子的精子生成，造成无精子症。女性甲亢多发生在育龄，甲亢没有治愈时孕妇可以造成先兆子痫、充血心衰、甲亢危象、妊娠高血压、胎盘早剥等，危及胎儿甚至可以造成死胎、早产、先天畸形、宫内生长发育迟缓。妊娠期甲亢还可以引起胎儿或新生儿甲亢。
鉴于这种情况，为孕妇和胎儿的健康、为保证孕妇和胎儿的安全，还是要等到甲亢治愈后再怀孕。如果妊娠期间发现甲亢，并且选择继续妊娠，原则上是进行抗甲亢药物治疗，或可以在妊娠中期进行手术治疗。所以临床常有甲亢合并妊娠的患者，由于抗甲亢药物对胎儿有致畸作用，需要根据情况和医生共同讨论治疗方案。孕前如有碘-131治疗，需要避孕半年方可妊娠，如果甲亢得到控制，病情稳定，生育功能也随之恢复，可以怀孕。